王梓枫派影组组员暗中将董卓会毒杀汉少帝的消息传给汉少帝，并且送去假死药，告知会在董卓毒杀汉少帝的时候，暗中派人接走汉少帝。
九月十二日，朝廷遥封远在幽州的幽州牧兼太尉刘虞为大司马，董卓由司空改任太尉，兼领前将军，加节，赐斧钺、虎贲，更封郿侯。
九月末，董卓联合司徒黄琬、司空杨彪一同携带鈇锧到朝堂上书，要求为建宁元年九月政变时，被政治诬陷为叛贼的陈蕃、窦武以及次年在“第二次党锢”中被捕遇害的众多党人平反。明面上刘协，实际为袁隗准奏，恢复陈蕃等人的爵位，并提拔他们的子孙为官。
董卓亲近周毖、伍琼，原大将军府官员何颙、郑泰也成为其幕僚。董卓在幕僚们的建议下，亲近士人，征召名士荀爽、韩融、陈纪等入朝为官，其中，蔡邕成为董卓最信任的幕僚。
同时，董卓又选拔馥、刘岱、孔伷、张咨、孔融、应劭、张邈等担任地方太守等要职，甚至不计前嫌，对厌恶自己而弃官而走的袁绍、王匡、鲍信等人授以太守，以示和解。
十月三日，董卓趁着何太后遗体下葬的时候，开启汉灵帝陵墓时，派人偷取其中珍宝。
董卓仗着军权的威势，放纵士兵在雒阳城内劫掠富户，搜刮财物，奸女，无恶不作。
十一月一日，董卓自拜相国，封郿侯，有“入朝不趋，剑履上殿”的特权，自此董卓在朝廷中的权势已经如日中天，无人可敌。
董卓又封自己的母亲为“池阳君”，设置令、丞。
董卓性格残忍，好用刑法立威。侍御史扰龙宗拜见董卓时忘了解除佩剑，董卓借题发挥，下令将其活活打死；又指使人将何太后的母亲舞阳君杀害，甚至将何苗的遗体从坟墓中挖出来肢解扔在园林之中。大司农周忠的儿子周晖听说雒阳变故，故至雒阳，董卓非常厌恶他，派兵将其劫杀。
张扬、曹操、卫兹等人都在地方招兵买马，试图对抗董卓执政，东郡太守桥瑁甚至伪造三公文书散发到各地州郡政府，陈述董卓罪恶，呼吁各地起兵反董，恢复刘辩的帝位。
初平元年正月十二日，董卓派弘农王郎中令李儒毒杀刘辩，以断绝桥瑁等反董联军的政治企图，殊不知暗门早已经用药物控制了李儒，暗中救下了汉少帝刘辩，完成了对汉灵帝刘宏的承诺，又派人送刘辩远居乡野，隐姓埋名，暗门暗中保护，王梓枫曾说过，刘辩没有君王之命，回归乡野，也许才是他最应该的归宿。刘辩经此一事，也已经认命，虽不是君王，但是乡野之中，也在暗门的帮助下成为一当地富户，一生只有一妻，育有一儿一女，对暗门也有一些帮助，后文自有提及，在此不做过多赘述。
广陵郡功曹臧洪说服太守张超，联合其兄陈留太守张邈一同举兵，兖州刺史刘岱亦加入，在酸枣举兵，自此关东反董之势如野火燎原，战火再起。